水培及基質培營養也的管理主要有四個方面，濃度、PH、溫度、溶解氧。
1.營養濃度
營養液的濃度有兩種因素決定，水以及營養液。氣溫高是作物的蒸騰作用會增強，會吸收蒸發大量的水分，這時需要注意水分的補充，主要體現在電導率，保持營養液電導率的穩定。元素補充時，生產用營養液一般是全價補充，單元素補充一般是科研用，
營養液的濃度也需要隨著作物生長周期調整，夏季濃度低，冬季濃度高，苗期濃度稍低，果期濃度高。栽培方式也會影響到營養液濃度的需求，水培的濃度會大，基質培則會相對低。
2，PH管理
營養液的配方有酸堿之分，但多數都是中性偏酸，在種植過程中需要PH值是穩定的。PH值可以選擇通過更換營養液來調節，不過成本比較高，那么就需要調節PH值了，稀硫酸以及稀硝酸進行調節，不過都不能大量使用。PH值一直都在變化，這就需要經常測定以及調節了。
3.溫度
營養液的溫度也會影響作物的生長發育，溫度控制好有利于增產。北方種植是容易發生營養液溫度過低的情況，可以選擇在儲存環節加電熱絲升溫。而夏天南方則溫度偏高，一般有兩種方法，一個是將營養液池挖深，另一種就是利用冷水機降溫。
4，溶氧量
基質栽培出現溶氧量不足的情況比較少，水培發生的比較多。一般氣溫高，氣壓低，溶氧量就會不足，植物就泡在營養液中就容易爛根，還有當溫度高時，植物的呼吸作用消耗 的氧氣就多。一般采取攪拌，壓縮空氣，循環流動等方式增加溶氧量。
還有一個問題很關鍵，那就是廢液的處理，亂排放廢液會污染環境，有條件的可以選擇處理后再利用，就是殺菌過濾等。還有就是循環利用，先對果菜類種植時使用，在進行葉菜類種植使用，在花卉種植時使用。
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