水培是在環(huán)境相對可控的條件下進行的，其作物生長的營養(yǎng)供應以及各種環(huán)境因子可以做到相對精準的調(diào)控，因此水培蔬菜的產(chǎn)量和品質(zhì)都是傳統(tǒng)土壤栽培無法比擬的，縱觀水培蔬菜的發(fā)展歷程及目前種植蔬菜品種的不同以及最終的經(jīng)濟效益的差別， 與傳統(tǒng)土壤栽培、基質(zhì)栽培相比，其主要的優(yōu)缺點如下：
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優(yōu)點：
一、產(chǎn)量高水培蔬菜通過營養(yǎng)液為根系直接提供營養(yǎng)和水分，因此蔬菜的營養(yǎng)供應更加充足、均衡和迅速，采用這種方式種植的蔬菜，在產(chǎn)量上要比傳統(tǒng)土壤栽培或基質(zhì)栽培的高幾倍甚至是十幾倍。
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二、品質(zhì)好因為是采用營養(yǎng)液來進行蔬菜的種植， 其營養(yǎng)供給均衡，并且可以根據(jù)蔬菜種類和生長階段的不同來進行營養(yǎng)供應的精準控制，而且是在溫室大棚等保護性設施條件下進行的，不易受到類似露地栽培那樣不利于生長的條件的干擾和影響，植株體內(nèi)不會過多地積累為抵御干旱、淹水、染病、蟲咬和營養(yǎng)不平衡等脅迫而產(chǎn)生的次生代謝物。所以水培蔬菜的口感更好，內(nèi)在品質(zhì)更佳。
三、易于自動化控制由于水培設施采用營養(yǎng)液作為提供植物根系生長的根際條件，其營養(yǎng)水平易通過自動控制設備進行精確控制，只需增加各種檢測探頭和相應的控制設備即可實現(xiàn)生產(chǎn)過程的自動化控制。
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四、設施設備管理簡單
水培設施設備采用管道或者各種可以盛裝營養(yǎng)液的種植槽等來進行種植，其設備相對簡單，只要將設施設備建設好，就可以對作物種植進行良好管理，而且水培的設施設備耐用，管理上較為方便。
缺點：
一、 投資較大
相對于傳統(tǒng)的土壤栽培或者是基質(zhì)栽培，因為水培的設施設備投資較大，造成了整個規(guī)?；嗍卟松a(chǎn)基地的投資較大，這是目前規(guī)模化水培蔬菜發(fā)展的一個瓶頸。但是，隨著各種簡化、耐用、低成本設施的研發(fā)，投資較大的問題也可以得到一定程度上的解決。
二、有可能出現(xiàn)病害的大量傳播
水培蔬菜的營養(yǎng)液是循環(huán)流動的， 如果種植系統(tǒng)中出現(xiàn)病害， 特別是根系病害時， 有可能出現(xiàn)病害的大范圍傳播。因此做好生產(chǎn)用水、育苗基質(zhì)的消毒、營養(yǎng)液和設施設備的消毒非常重要。
三、技術要求較高
水培蔬菜是在營養(yǎng)液中進行的， 它沒有傳統(tǒng)土壤栽培中土壤的緩沖性， 因此對營養(yǎng)液濃度、各營養(yǎng)物質(zhì)比例、酸堿度以及溫度等條件的控制就需更加嚴格。因此，在管理和控制的技術上要求更高。