對作物栽培生長有較大影響的基質化學性質主要包括基質的化學組成及由此引起的化學穩定性、酸堿性、鹽基代換量(陽離子代換量)、緩沖能力和電導度等。
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1、基質的化學組成：基質本身含有的化學物質種類及其含量，既包括作物可以吸收利用的礦質營養和有機營養，也包括對作物生長有害的有毒物質。基質的化學穩定性是指基質發生化學變化的難易程度。無土栽培中要求基質有很強的穩定性，且不含有毒物質。基質的化學穩定性因化學組成不同而差異很大。
2、基質的酸堿性：基質的酸堿性各不相同，既有酸性，也有堿性，也有中性。無土栽培要求基質的酸堿性相對保持穩定，最好呈中性或微酸性。過酸、過堿都會影響到營養液的平衡與穩定，從而影響作物的生長發育。
3、鹽基代換量：在一定的酸堿度下，基質含有可代換性陽離子的數量稱為陽離子代換量。其反映基質對養分的吸附能力。基質的陽離子代換量有不利的一面，即影響作物對營養液的吸收，也有有利的一面，即保存養分，減少損失和對營養液的酸堿度反應有緩沖作用。
4、基質的導電度：基質在未加入營養液之前，基質本身具有的電導率。它表明基質內部已電離鹽類的溶液濃度，反映基質中原來帶有的可溶性鹽分的多少。
5、基質的緩沖能力：基質在加入酸堿物質后，基質本身所具有的緩和酸堿性(pH)變化的能力。緩沖能力的大小主要由陽離子代換量以及存在基質中弱酸及鹽類的多少而定。一般陽離子代換量高的，其緩沖能力大。